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2022-06-27
Nature子刊:單細胞分析揭示息肉→腸癌過程中細胞的連續變化
①收集48個息肉、27個正常組織和6個有或沒有APC突變患者的CRC樣本,進行scATAC和scRNAseq分析。
②大部分息肉和CRC細胞具有乾細胞樣表型,並鑑定出其從穩態發展到CRC時發生的一系列表觀遺傳和轉錄變化。
③晚期息肉中乾細胞樣細胞...
2022-06-08
Nature Reviews:藥物、天然化合物和污染物與腸道菌群的互作(綜述)
①通過飲食和藥物攝入,腸道菌群會接觸大量異生物質。
②除了抗生素,靶向宿主的藥物、天然食品成分和食品添加劑、農藥和其他污染物等異生物質,都可影響腸道菌群的組成。
2022-06-06
Nature子刊:RNA剪接或是結直腸癌的治療新靶點
①腫瘤細胞的可塑性是癌症靶向治療的主要障礙之一。
②抑癌基因Apc缺陷的結直腸癌細胞中Wnt信號過度激活,導致RNA剪接因子表達和RNA可變剪接失調。
③篩選發現剪接因子SRSF1參與這一過程,SRSF1單倍缺失削弱腸細胞可塑性,抑制結直腸癌(C...
2022-06-03
Science:微生物高通量單細胞測序,助力在菌株水平上解析腸道菌群
①開發具有菌株分辨率的微生物高通量單細胞測序方法Microbe-seq,該方法結合了基於液滴的微流控技術和專有的生信分析流程,能從復雜菌群中獲得單個細菌的基因組信息。
2022-06-02
Cell子刊:細菌鞘脂調節宿主腸-肝軸
①通過生物正交標記脂質可以追踪腸道共生菌-多形擬桿菌中鞘脂的合成及轉移。
②多形擬桿菌可以合成一組含高絲氨酸的鞘脂,並從腸道菌群轉移到小鼠的結腸和肝臟。
③細菌高絲氨酸鞘脂可改善肝細胞中的氧化呼吸和脂肪堆積。
2022-06-02
Cell子刊:菌群代謝物促進老年認知功能衰退的新機制
①瘤胃球菌科產生的小分子代謝物異戊胺(IAA)在老年小鼠和老年人中富集,這與瘤胃球菌科的噬菌體(如肌尾噬菌體科)減少有關。
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