熱心腸研究院

Science:微生物高通量單細胞測序,助力在菌株水平上解析腸道菌群

①開發具有菌株分辨率的微生物高通量單細胞測序方法Microbe-seq,該方法結合了基於液滴的微流控技術和專有的生信分析流程,能從復雜菌群中獲得單個細菌的基因組信息。
②用該方法分析人腸道菌群樣本,得到21914個單細胞微生物基因組信息,組裝出76個物種水平基因組(52個為高質量),發現10個物種含有多個菌株,並組裝了菌株水平的基因組。
③用這些基因組分析了菌群多樣性,構建了菌群的水平基因轉移網絡(發現HGT主要發生在同菌門的菌株之間),並探索了噬菌體與宿主菌的相關性(發現crAssphage只與一個普通擬桿菌菌株有明顯關聯)。


資料來源出處: 熱心腸研究院Science