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2022-07-22
Cell子刊:Akk菌或可成為致病性大腸桿菌的幫兇?
①黏附侵襲大腸桿菌(AIEC)等利用L-絲氨酸的細菌在炎症性腸病患者中體內富集。
②限制L-絲氨酸飲食通過腸道菌群加劇DSS誘導的小鼠結腸炎,同時導致致病性的AIEC和嗜粘蛋白阿克曼菌(Akk菌)大量繁殖。
③Akk菌對粘液層的降解促進AIEC...
2022-07-15
Science子刊:對新冠病毒的預存免疫可能源於對共生菌的交叉反應
①分析疫情前的健康人血液樣本,採用pMHC四聚體染色和富集方法,鑑定出預存的新冠病毒特異性CD4+ T細胞,一大部分為記憶T細胞。
②這些預存的新冠病毒特異性T細胞具有多樣化的特徵,包括多種極化狀態和向屏障組織(如腸道、皮膚)遷移的潛力。
2022-06-27
Nature子刊:單細胞分析揭示息肉→腸癌過程中細胞的連續變化
①收集48個息肉、27個正常組織和6個有或沒有APC突變患者的CRC樣本,進行scATAC和scRNAseq分析。
②大部分息肉和CRC細胞具有乾細胞樣表型,並鑑定出其從穩態發展到CRC時發生的一系列表觀遺傳和轉錄變化。
③晚期息肉中乾細胞樣細胞...
2022-06-08
Nature Reviews:藥物、天然化合物和污染物與腸道菌群的互作(綜述)
①通過飲食和藥物攝入,腸道菌群會接觸大量異生物質。
②除了抗生素,靶向宿主的藥物、天然食品成分和食品添加劑、農藥和其他污染物等異生物質,都可影響腸道菌群的組成。
2022-06-06
Nature子刊:RNA剪接或是結直腸癌的治療新靶點
①腫瘤細胞的可塑性是癌症靶向治療的主要障礙之一。
②抑癌基因Apc缺陷的結直腸癌細胞中Wnt信號過度激活,導致RNA剪接因子表達和RNA可變剪接失調。
③篩選發現剪接因子SRSF1參與這一過程,SRSF1單倍缺失削弱腸細胞可塑性,抑制結直腸癌(C...
2022-06-03
Science:微生物高通量單細胞測序,助力在菌株水平上解析腸道菌群
①開發具有菌株分辨率的微生物高通量單細胞測序方法Microbe-seq,該方法結合了基於液滴的微流控技術和專有的生信分析流程,能從復雜菌群中獲得單個細菌的基因組信息。
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