由中央研究院、長庚大學微生物相研究中心、臺北醫學大學、圖爾思生技共同舉辦的「第三屆亞洲微生物體趨勢論壇」是2019年初臺灣集合學研與業界最盛大的微生物體學嘉年華，於1月10至11日，假中研院人文社會科學館舉辦，為期兩天的論壇座無虛席，報名參加人數超過300人，表明微生物研究趨勢已經成為顯學。
論壇共規劃了「人體腸道微生物」、「人體微生物」、「動植物與環境微生物」、「微菌叢植入術(FMT)」、「營養與益生菌」以及「生物資訊領域」等六大主題，並聚焦微生物與癌症的研究，以期為臺灣微生物研究帶來更多發展的機會與動能。
會議由圖爾思副總經理、微生物體研究中心劉君豪執行長主持，中央研究院副院長劉扶東院士親臨致詞，為論壇揭開序幕。
產學研醫專家多樣化合作 探討微生物體新領域
本身也是皮膚及過敏專家的劉扶東副院長表示，目前人類尚不完全清楚在人體中有多少微生物，但根據估計，人體中微生物所擁有的基因數加總起來，可能為人類本身的100倍以上。目前已知微生物的組成與佔比會影響到人體的健康，許多研究也證實，幾乎各種疾病發生與微生物體(Microbiota)有關，甚至生物學中的各領域也幾乎與微生物畫上連結，是一個非常蓬勃的新領域。
劉副院長強調，因為微生物體學本身的複雜性，要進行這類研究必須結合不同領域的人才一起合作。
本次論壇即凝聚產業界與學研醫專家的多方思考。
腸道菌相具疾病檢測潛力
論壇首先由臺灣特定疾病臨床試驗合作聯盟(TCTC)計畫主持人、臺大醫院吳明賢醫師以「個人化營養和腸道微生物群」為主題開始。吳明賢醫師曾任臺大醫學院副院長，專長為幽門螺旋桿菌與消化道疾病。吳明賢醫師表示，腸道菌在人體中非常多樣，以菌種而論，可能就多達1,000種，而且腸道是一種動態器官，隨著時間不同，腸道內的食物成分也會不同，腸道菌能夠影響人體的代謝跟免疫，現今就發現許多疾病可能是由於微生物失衡所造成。
此外，腸道菌相也有疾病檢測的潛力，吳明賢團隊發現，冠狀動脈心臟病的病人，其腸道菌相就和健康的人不一樣。
因此，後天的飲食以及抗生素等都有可能影響人體的菌相。
而人類對食物的偏好也可能與腸道菌有關。在腸道中人體能分解多醣的酵素有限，很多都需要透過腸道菌消化，在代謝過程中，這些醣可能會產生一些生物酸，或是短鏈脂肪酸，對人體都有重要的功能。
以腸道菌影響人體代謝為例，肉類食物中的膽鹼、肉鹼會由腸道菌代謝為氧化三甲胺(TMAO)，提高心血管疾病風險，因此氧化三甲胺有機會做為一個生物指標參考。
由於TMAO在人體中代謝速度較快，因此在研究中，吳明賢團隊利用TMAO的口服膽鹼試驗(Oral Choline Challenge Test)，測試出某些族群在服用了代謝前驅物後，血液中的TMAO就上升了，而其他人則不會，因此可以區分出潛在的高風險族群。
中草藥影響菌相 改變微生物組成
長庚大學賴信志教授投入微生物體的研究已久，此次以「從益生質、益生菌到後生元」(From Prebiotics, Probiotics to Postbiotics)為主題分享，他表示，傳統中草藥中有許多具有活性的益生質(Prebiotic)，食用後可以幫助身體改善微生物狀態，形成益生菌(Probiotic)，並對身體形成有利的影響。他的目標就是透過這些益生質找到有利於人體的益生菌，並研究這些益生菌產生的有效物質，找出有功效的後生元。賴信志教授希望透過結合傳統中草藥效用及知識，了解其作用機制，並萃取出活性物來幫助微生物菌相的研究。
他也表示，中草藥透過不同的萃取方式可以取得諸如增進免疫效果、抑制發炎等效果的物質。
到目前為止，飲食性疾病預防的效果似乎並不明顯，他好奇的是，傳統中草藥對菌相的影響，是否可以改變微生物組成，或是影響代謝跟腸道環境。
以牛樟芝為例，團隊發現牛樟芝的水萃物質在減肥上有很好的效果，也成功分離出與此有關的微生物；在靈芝的水萃物中發現了可以促進某些微生物的生長，其中有些微生物可以生成短鏈脂肪酸，代謝出各種物質。由此可以看出飲食功效與人體微生物間的複雜關聯。
建立皮膚益生菌銀行
存在於人體內外的「人體微生物群」(Human Microbiome)數量十分龐大，這些微生物與人體形成一種共生關係。中央大學黃俊銘教授分享「皮膚益生菌銀行(Skin Probiotic Bank)」計畫，指出健康的皮膚菌相對人體的重要性，並希望未來能區分出不同地區、不同人種的皮膚菌相，不只是儲存，還有交換，以及應用。
黃俊銘教授過去研究痘痘疫苗，目標是克服痤瘡桿菌。他強調，疫苗並不是要殺死微生物，而是要將它們抑制在適合的範圍，因為研究發現，這種常見的細菌雖然可能造成發炎，可是到了年老的時候，這些微生物對皮膚也有好處。
舉例來說，洗腎病人因為代謝問題，無法有效地排除身體裡的磷跟鈣，並累積在皮膚表面而造成搔癢。然而，體表有痤瘡桿菌的人，皮膚搔癢的狀況會減少。
此外，痤瘡桿菌也可以在人體表面代謝醣類，並產生短鏈脂肪酸，這些脂肪酸具抗發炎等有益的功能。
關於如何進行身體益生菌菌相的編輯(Editing)，他表示，菌相的編輯不是用抗生素去殺死細菌，也不是單純提供養分養菌，而是要用特別的醣類或是養分，特定給予某些具有代謝能力的菌種使用，幫助這些人類需要的微生物成長。
口腔菌相與口腔癌突變關係
長庚醫院蘇仕奇博士分享口腔細菌組成和變化與口腔癌突變的關係，他表示，口腔內的細菌非常豐富，大約有770種不同的菌種。唾液的酸鹼值大約pH 6.5~7.5，非常適合細菌生長。人類口腔菌相在換完乳牙後大概就不太會改變，其中穩定度最高的是舌頭，再來是唾液，它們甚至不受時間的影響，因此很適合作為生物標記(Biomarker)的來源。
大約50%口腔癌的患者確診時已經為晚期，因此科學家希望可以開發出早期診斷的方法。
口腔中有許多不同的因素影響到口腔的菌相，在口腔取樣中也分不同的部位與不同的取樣法，研究主要聚焦於口腔癌症的基因突變模式是否與口腔中的菌相有關。
口腔中可能因為不同的原因如老化、吸菸、飲食習慣等形成不同壓力，而壓力的累積最終造成細胞突變與癌症。這些變化的壓力也會影響口腔中的微生物菌相，他指出，透過不同的癌症突變分類搭配菌相分析，可以發現突變似乎與特定的菌相模式有關聯。
蘇博士表示，雖然，目前口腔癌與口腔細菌中的因果關係仍不比大腸癌與腸道菌間那麼明確，也許癌細胞的代謝物也會影響微生物的組成，這其中的機制與原理值得研究。
資料來源 : 環球生技月刊